（图文|通讯员辛西）9月10日教师节，美国康涅狄格州杰克逊实验室的阮小安教授做客公司信息逸站，作了一场名为“SMRT sequencing for long reads, the feature, value and applications” 的学术报告，对第三代单分子测序技术的原理、构造和应用方面进行介绍。

阮小安教授首先为我们展示了杰克逊实验室最新的、由美国Pacific Biosciences公司发售的第三代测序仪PacBio RSII，并介绍了用这种仪器在杰克逊实验室所做的测序案例。PacBio测序仪用到的配件是SMRT Cell chip, 一个条带上可以放8个SMRT cell。每个SMRT Cell底部有150000个小孔，聚合酶锚定在测序芯片底部，每个孔有单分子DNA链在高速合成，用4种荧光标记4种dNTP,配合高分辨率的激光检测系统，能实时进行单分子测序。

与二代测序仪相比，PacBio的显著优势是测序长度超长，目前最长能达到60KB，弥补了二代测序在基因组组装中存在gap较多的缺点。其次，由于在文库准备阶段没有进行PCR扩增，所以PacBio能直接检测出序列中的碱基修饰。这使得直接进行甲基化测序变得容易。该技术对GC的偏向性小，并且测序速度快，上机时一秒可以测3个碱基。但也存在一些缺点，比如单次测序的碱基错误率较高。因为每次测序的错误是随机产生的，所以对单条序列进行多次测序后，可以通过统计来修正错误，降低错误率。另外，可以用Illumina平台的高准确度、高通量的短序列来校正PacBio的长序列。

随后，阮小安向大家介绍了PacBio测序仪的工作流程，包括样品的准备、文库的制备、引物的连接、Megabead捕获的过程和测序结果的呈现等等。同时强调了文库质量的重要性，文库质量决定了测序结果的好坏。最后介绍了第三代单分子测序技术的应用前景，如基于编码的多样本测序等。